Vsak zob ima pet izpostavljenih površin, vendar lahko standardna zobna ščetka očisti le tri od njih; preostali dve površini zahtevata uporabo medzobne ščetke. Uporaba medzobne ščetke je priznana in zelo učinkovita metoda za odstranjevanje zobnih oblog.
Vsakodnevna uporaba medzobne ščetke, ki služi kot dodatek standardni zobni ščetki, je preprost, a učinkovit način za ohranjanje zob in dlesni čistih in zdravih. Čiščenje z medzobno ščetko pomaga preprečiti vnetje dlesni, zobno gnilobo in slab zadah.
Uporablja se za odstranjevanje oblog z zobnih površin in medzobnih prostorov, ki jih je sicer težko očistiti. Na primer, na območjih, kot so konkavne površine premolarjev-ki jih niti zobna nitka niti standardna zobna ščetka ne moreta doseči-, lahko uporabite ustrezno oblikovano medzobno ščetko z gibi naprej-in-nazaj, da odstranite zobne obloge iz koreninskih brazd, konkavnih zobnih površin in distalnih površin zadnjih kočnikov.
V primerih nepravilne poravnave zob, zapletenih zobnih restavracij, recesije dlesni ali izpostavljenih razpok korenin lahko uporabite specializirane medzobne ščetke za odstranjevanje ostankov med zobmi; v ta namen so očitno boljši od zobotrebcev ali zobne nitke. Optimalne rezultate čiščenja dosežemo, ko ščetko pritisnemo na interproksimalne površine zob. Uporabni so tudi za čiščenje ortodontskih aparatov, fiksnih restavracij, zobnih vsadkov, parodontalnih opornic, vzdrževalcev prostora in drugih predelov, ki so težko dosegljivi s standardno zobno ščetko.
